محققان فهرستی از جهش‌های پروتئین خار SARS-CoV-2 را تهیه کردند که می‌تواند نوع Omicron را در برابر آنتی‌بادی‌های خنثی‌کننده، از جمله آنتی‌بادی‌های حاصل از واکسیناسیون، مقاوم‌تر کند.
این ممکن است خطر ابتلا به موارد ناگهانی COVID-19 را افزایش دهد.
از آنجایی که ویروس SARS-CoV-2 جهش خود را متوقف نخواهد کرد، هدف ما ارائه منبعی به جامعه برای شناسایی سریع، جمع آوری و به اشتراک گذاری داده های با کیفیت بالا است.
یک پست وبلاگ توسط Gene Godbold، دانشمند ارشد Signature Science LLC، 9 مورد از ده ها جهش و حذف ژنتیکی گزارش شده در نوع Omicron را فهرست می کند که محققان گمان می کنند به ویروس کمک می کند تا از آنتی بادی ها جلوگیری کند.
تاد ترینگن، دانشمند کامپیوتر دانشگاه رایس، گفت: داده‌ها باید به‌عنوان یک نشریه بررسی‌شده ارسال شوند، اما گسترش سریع Omicron در سراسر جهان فوریت را برای خلاصه‌سازی و به اشتراک گذاشتن یافته‌ها می‌دهد، در حالی که انتظار می‌رود داده‌های بیشتری برای ارزیابی تأثیرات آن انجام شود. گادبولد و شرکتش در هیئت مدیره.
Treangen مدت‌هاست که در پرداختن به چالش‌های محاسباتی ناشی از جریان فعلی داده‌های پزشکی، با تمرکز ویژه بر ردیابی همه‌گیری، تخصص داشته است.
Godbold می‌گوید این پروژه به تیم اجازه داده است تا تعداد زیادی از داده‌های جمع‌آوری‌شده درباره ویروس را خلاصه کند.
او گفت: «کاری که ما انجام می‌دهیم این است که میلیون‌ها توالی ژنومی SARS-CoV-2 را با ترکیب نقل‌قول‌ها و توالی‌های ادبیات به گونه‌ای که تفسیر گونه‌های ویروسی جدید را بلافاصله پس از مستندسازی آسان‌تر می‌کند، معنا کنیم.»
گادبولد می‌گوید: «این نوع ارزیابی بدون صدها محقق در سراسر جهان که سال‌های انسانی بی‌شماری را روی ویروس کار کرده‌اند تا تعیین کنند که جهش‌ها در هر دو محیط آزمایشگاهی و بالینی چگونه کار می‌کنند، انجام نمی‌شد.
اگرچه داده‌های بیشتری برای ارزیابی شدت موارد COVID-19 از عفونت Omicron مورد نیاز است، Godbold می‌نویسد که این نوع احتمالاً SARS-CoV-2 را نه تنها قابل انتقال‌تر می‌کند، بلکه می‌تواند از خنثی کردن آنتی‌بادی‌های ناشی از واکسیناسیون بهتر از آن جلوگیری کند. انواع قبلا دیده شده
او می‌نویسد: «این بدان معنا نیست که احتمالاً واکسیناسیون با نوع Omicron شکست می‌خورد، اما محافظت ارائه شده توسط واکسیناسیون احتمالاً فرارتر از انواع اضطراب قبلی است.
این یافته بخشی از پروژه‌ای است که در ماه جولای با کمک هزینه CDC برای توسعه نرم‌افزار Harvest Variants آزمایشگاه Trendgen برای ردیابی یکپارچه و مشترک انواع SARS-CoV-2 آغاز شد. Godbold و همکارانش در Signature Science برای نظارت بر نسخه‌های ویروس و آزمایش نرم‌افزار و خدمات اسناد شخص ثالث قرارداد بسته‌اند.
نرم افزار Harvest که توسط Treangen در سال 2014 معرفی شد، به گونه ای طراحی شده است که مجموعه ای از ابزارها برای همسوسازی و تجسم یک هسته / ژنوم میکروبی منبع باز است که امکان نظارت در زمان واقعی جهش های ویروسی را فراهم می کند.
Treangen می گوید که هدف تیم تحقیقاتی ساخت علم کامپیوتر و ابزارهای محاسباتی است که تجزیه و تحلیل سریع را ممکن می کند.
او گفت: «از آنجایی که ویروس SARS-CoV-2 جهش خود را متوقف نخواهد کرد، هدف ما ارائه منبعی به جامعه برای شناسایی سریع، جمع‌آوری و اشتراک‌گذاری داده‌های با کیفیت بالا است که مکمل تلاش‌های مرتبط در سراسر جهان است.»
مراکز کنترل و پیشگیری از بیماری ها این پروژه را تامین مالی کردند.
منبع: دانشگاه رایس
[ad_2]
مقالات مشابه
- John Lewis: خوب مشکل تکان دهنده, شادی, مستند در مورد خستگی ناپذیر آزادی جنگنده
- خانه دموکرات پرده جدید از 3 تریلیون coronavirus امداد لایحه از جمله پول برای دولت های ایالتی و محلی
- اتحادیه اروپا رونمایی coronavirus برنامه ردیابی دستورالعمل
- After Police Shooting Spurs Further Unrest in Chicago, Community Members Ask What Comes Next
- اسرائیل به استفاده از counterterror ابزار برای پیگیری قرنطینه شکن
- یک داستان از 2 شهرستانها: ونیز ساکنان پاره بین توده گردشگری و هماهنگ تر وجود
- بوسنی حبس برای قاچاق قطعات تفنگ برای نئو نازی ها-ارتباط مشتریان در سوئد
- کربن فعال درمان شیمیایی
- International donors pledge $398.7M in emergency aid for Lebanon
- خیره کننده باپتیست جنوبی جنجال بر سر دونالد مغلوب ساختن پیشی جستن و راسل و مور توضیح داد